Santri yang mengalami keracunan total ada sebanyak 121 santri (laki-laki dan perempuan). Mereka yang mengalami keracunan kemudian dilarikan ke empat layanan kesehatan, yaitu RSUD dr Hardjono sebanyak 64 Santri, PKM Ngrandu sebanyak 20 santri, PKM Kauman sebanyak 23 santri, RS Aisyah Ponorogo sebanyak 14 santri. Sebagian besar korban merupakan siswa-siswi MTs dan MA yang dalam pengelolaan makan sehari-hari menjadi satu di satu dapur di ponpes.
Kejadian bermula sekitar pukul 18.30 WIB, Minggu (17/11), bertepatan waktu jam makan malam. Saat itu, para santri melaksanakan makan malam dengan lauk ikan laut jenis tongkol yang dibeli dari pedagang di Kecamatan Sawoo dan kemudian dilanjutkan dengan melaksanakan sholat Isyak berjamaah.
Sejam kemudian, atau sekitar pukul 19.30 WIB ustad pendamping mendapat laporan dari santri bahwa banyak santri mengalami pusing, mual dan mata merah. Para santri diduga mengalami keracunan, sehingga kemudian ustad pendamping mengumpulkan para santri yang kesakitan itu untuk dilakukan penanganan awal.
