Almarhum disholatkan di Masjid Ar Roudhoh dan dikebumikan di Komplek Pemakaman Al Hadad Kota Tegal.
Jumadi menyampaikan, masyarakat kehilangan sosok ulama yang kharismatik, tegas, dan mempunyai prinsip yang kuat. Ia menggambarkan Almarhum Habib Thohir merupakan sosok ulama yang mengayomi. Almarhum menjadi guru sekaligus orangtua bagi semua masyarakat di Kota Tegal.
